Organisasi dan Ekstrakurikuler Berprestasi yang ada di MAN 3 Kota Makassar :
1. OSIM
2. MPK
3. Rohis
4. Pramuka
5. Paskibraka
6. Palang Merah Remaja
7. Kelompok Ilmiah Remaja
8. Kertas Seni
9. Marching Band
10. Olahraga
11. Pencak Silat
12. Taekwondo